现主要研究方向为艺术与科学、美术学、教育学，提出并倡导“生命即艺术·艺术即科学·科学即艺术”的艺术与科学审美终身教育理论，创设《艺术与科学审美实验课程》体系。发起《艺术与科学之问》国际学术论坛，编著《艺术与科学》四册中国科学院大学内部教学丛书，为国家培养了第一届艺术与科学研究方向的博士生。

代表作品《野花与玫瑰》2010年荣获得法国沙龙艺术展（卢浮宫）最高奖“沙龙特别奖”，《笼里与笼外》2012年荣获法国沙龙艺术展（卢浮宫）“银奖”，《树与桥》被赠予前俄罗斯联邦总统梅德韦杰夫收藏。作品入选第八届、第十一届、第十二届全国美展及国际艺术展，多次获得国家级、省部级重要奖项。曾出版《素描法度》《色彩法度》《石自东作品集》等学术专著。二百余件作品发表出版在《美术》《中国油画》《文艺研究》等学术核心期刊及《世界美术工作室》《中国美术全集》《中国油画典藏》《具有学术价值和市场潜力的艺术家》等画集。大型艺术个展“WHO AM I？——A close scrutiny on the Chinese culture values after 1978”（2010-2011）在国内外巡展。作品被国内外多家博物馆、美术馆、企业、艺术机构等收藏。